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可視化生信分析平臺

BMK Cloud

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革新傳統(tǒng)生信數(shù)據(jù)分析模式

科研項目對于個性化分析需求量日益增加,在未來,快速完成生信分析是科研團隊的必備能力之一,借助百邁客云科研人員可以自主完成生信數(shù)據(jù)的深入挖掘,再也不用受制于人。

系統(tǒng)架構(gòu)

基礎功能展示

合理布局的總覽頁

可視化的項目管理

數(shù)據(jù)可視化管理

會員管理系統(tǒng)更安全

軟件配置表

系統(tǒng)

模塊

功能說明

備注

平臺操作系統(tǒng)

文件系統(tǒng)

用于兼容硬件層不同的文件系統(tǒng)

必選

計算系統(tǒng)

用于計算任務的調(diào)度和生命周期管理

計算系統(tǒng)管理平臺

底層任務和集群的監(jiān)控和管理,用于監(jiān)控和管理集群中任務的運行狀況,管理集群狀況

管理員系統(tǒng)

用戶管理

添加、刪除用戶,修改用戶信息

權(quán)限管理

為不同用戶設置可以使用的功能權(quán)限

項目管理

用于進行項目推送、數(shù)據(jù)推送,查看推送隊列

用戶系統(tǒng)

用戶系統(tǒng)

用戶注冊、登陸、認證系統(tǒng),用戶信息管理

站內(nèi)信

管理用戶的站內(nèi)信,用于接收通知等內(nèi)容

數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)

我的數(shù)據(jù)

圖形化的數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),包含公共數(shù)據(jù)和個人數(shù)據(jù),支持頁面或ftp上傳數(shù)據(jù)

項目管理系統(tǒng)

我的項目

將項目進展、任務、數(shù)據(jù)、報告統(tǒng)一放到項目中進行管理

我的任務

監(jiān)控和處理運行的任務和歷史任務

分析系統(tǒng)

分析平臺

可選擇分析平臺包含:
真核生物有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺;
真核生物無參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺;
小RNA測序分析平臺;
circRNA測序分析平臺(只有標準分析);
長鏈非編碼RNA測序分析平臺;
全轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析平臺(只有標準分析);
有參全長轉(zhuǎn)錄組(ONT)分析平臺(只有標準分析);
蛋白質(zhì)組分析平臺;
代謝組分析平臺;
微生物多樣性分析平臺;
全基因組重測序分析平臺;
外顯子組測序分析平臺;
ChIP-Seq分析平臺(只有標準分析)。

必選1個
選擇真核有參,則必須配套購買參考基因組數(shù)據(jù)庫

繪圖工具

目前可繪制:熱圖、韋恩圖、柱圖、餅圖、箱線圖、散點圖、點線圖、面積圖,特點:1.調(diào)整圖片樣式(以最佳方式展示數(shù)據(jù)的分布);2.交互查看(點擊圖片相應區(qū)域,查看對應數(shù)據(jù))。

可選

FASTA工具

FASTA工具集是一款針對FASTA格式序列的綜合性處理軟件。包括FASTA序列提取、過濾、長度分布圖繪制、格式轉(zhuǎn)換、統(tǒng)計等一系列功能。

可選

表格工具

表格工具可對用戶的各種表格文件進行方便快捷的操作,可以實現(xiàn)表格行列名編輯、表格排序、表格篩選、表格合并的功能。

可選

工具

搭配標準分析完成更多個性化分析,100+款涵蓋:繪圖、質(zhì)控、數(shù)據(jù)提取、序列分析、比對、統(tǒng)計、遺傳進化、基因分析、組裝、ncRNA等。

可選
也可以只購買部分工具

數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)

參考基因組數(shù)據(jù)庫

共匯總了975個物種的861個基因組信息,其中138個物種包含190個參考基因組序列信息。

可選

功能基因數(shù)據(jù)庫

功能基因數(shù)據(jù)庫收錄了25個數(shù)據(jù)庫的近1700萬條基因的相關(guān)信息,可通過功能關(guān)鍵詞或基因ID進行檢索。

項目管理高通量測序數(shù)據(jù)庫

收錄的SRA項目超過9萬,樣品超過360萬,實驗信息超過260萬。

文獻數(shù)據(jù)庫

與Pubmed同步,增加了過濾欄,可以針對性查找,簡化文章檢索后期篩選過程,節(jié)省寶貴時間,可一鍵保存相關(guān)數(shù)據(jù)。

定制化數(shù)據(jù)庫

整合基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白組學、代謝組學等多組學數(shù)據(jù),呈現(xiàn)給其他人查看和使用。

培訓

線上培訓

部署后遠程培訓1次(帶考試),時長2小時內(nèi)。
用戶加微信/QQ群進行后續(xù)使用交流。

1次線上培訓

線下培訓(線上培訓后執(zhí)行)

現(xiàn)場培訓(包含講師差旅住宿),報價為按天收費。
培訓內(nèi)容1:平臺使用培訓。包括現(xiàn)場演示,課后答疑,上機操作。
培訓內(nèi)容2:平臺管理員培訓。
培訓內(nèi)容3:使用平臺必要的生信知識培訓。

1次為期2天的線下培訓

更新

參考基因組數(shù)據(jù)庫更新

添加可用于APP分析的新的物種或新版本的參考基因組數(shù)據(jù)

可免費部署10個額外版本的參考基因組

系統(tǒng)功能的更新

已部署功能升級到最新版,包含:平臺操作系統(tǒng)、管理員系統(tǒng)、用戶系統(tǒng)、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)、項目系統(tǒng)、已購買分析系統(tǒng)

交付后2年內(nèi)免費更新1次

維護

軟件系統(tǒng)維護

1、維護內(nèi)容:系統(tǒng)使用問題解決、任務異常問題解決、集群調(diào)整及搬遷,保證系統(tǒng)正常使用;
2、服務時間:法定工作日*8小時;
3、響應時間:服務時間內(nèi)響應時間為1小時;服務時間外響應時間8小時。
報價包含必要的上門維修費用。

交付后1年內(nèi)免費維護

計算資源調(diào)整

增減或者調(diào)整計算節(jié)點。按照每臺每次操作進行收費。

可選

推薦硬件配置

名稱

詳細配置

數(shù)量

管理/存儲節(jié)點

2U機架式服務器,支持2CPU
具體配置如下:
???– 2個銀牌4110 CPU(8核/16線程, 2.1GHz, 9.6GT/s, 11MB Cache)
???– 8根16GB RDIMM 2666MT/s服務器內(nèi)存
???– 4塊600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企業(yè)級硬盤
???– 12塊8T 7.2K RPM NLSAS 12Gbps 3.5英寸企業(yè)級硬盤,實際可用80T
???– Broadcom 5720 QP 1Gb 網(wǎng)絡子卡
???– 2個750W服務器電源
???– 硬件遠程訪問控制器
???– 3年4小時上門服務(7*24*4)

1

計算節(jié)點

1U機架式服務器,支持2CPU
具體配置如下:
???– 2個金牌5120 CPU(14核/28線程, 2.2GHz, 10.4GT/s, 19.25MB Cache),共28核
???– 8根32GB RDIMM 2666MT/s服務器內(nèi)存,共256G內(nèi)存
???– 1塊600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企業(yè)級硬盤
???– Broadcom 5720 QP 1Gb 網(wǎng)絡子卡
???– 2個750W服務器電源
???– 硬件遠程訪問控制器
???– 3年4小時上門服務(7*24*4)

2

交換機

1U機架式以太網(wǎng)交換機
具體配置如下:
???– 24個1Gb 網(wǎng)絡接口
???– 2個10GbE SFP+ 光纖接口
???– 3年4小時上門服務(7*24*4)

1

機柜

1 × 19″ 42U 600*1000 標準機柜
2路PDU
???– 32A工業(yè)連接器輸入
???– 12口10A萬用插口輸出

1

成功案例

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